Ces journées sont l’occasion pour la communauté bioinformatique du MNHN au sens large de se réunir. Ce fut ainsi l’occasion d’échanger autour d’une grande diversité d’outils et de méthodes, des bases de données, des pipeline d’analyse de transcriptomique spatiale ou encore des outils d’annotation basé sur de l’intelligence artificielle. Des applications de ces méthodes dans des contextes variés ont également été discutées; de la génétique des populations humaines au positionnement des nucléosomes chez la souris.
Session 1
13h10-13h35: Alexis Martin et Charlotte Chazeau - Data curation, fisheries and ecosystem-based
management: the case study of the Pecheker database
13h35-14h00: Julien Pichon - Évolution de l’ADN centromérique chez les cercopithèques
14h00-14h25: Marie Cariou - Kefir-ensemble: Quelles outils pour l’intégration de données de
métagénomiques à grande échelle dans le cadre d’un projet de science participative?
14h25-14h50: Léa Guyon - Modéliser des systèmes patrilinéaires pour expliquer le goulot
d’étranglement génétique du chromosome Y à la fin du Néolithique
Session 2
15h20-15h45: Pilar Rodriguez - Analyse bioinformatique de données de transcriptomique spatiale :
Exploration de l’effet combiné de l’exposition aux perturbateurs endocriniens et au
régime gras et sucré sur la signature transcriptomique des différentes noyaux de
l’hypothalamus chez la souris
15h45-16h10: Maxime Christophe - Perturbation de réseaux de neurones pour comprendre le
positionnement des nucléosomes chez la souris
16h10-16h35: Tristan Tchilinguirian - Intelligence artificielle et annotation : un outil essentiel pour les
experts
16h35-17h00: Julien Mozziconacci - PLANETOID: deeP LeArNing-based gEnome annoTation Of bIoDiversity