Plateau de biologie moléculaire : extraction, amplification, séquençage, génotypage

Présentation
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Le Service de Systématique Moléculaire (SSM) est un plateau technique de la Direction Générale Déléguée à la Recherche (DGD REVE), membre de la Plateforme Analytique du Muséum (PAM). Le SSM dispose de locaux et d'agents sur les sites du Jardin des Plantes et de la Station marine de Concarneau.

 

Le plateau a pour objectifs :

  • d'offrir un accès mutualisé aux moyens techniques et analytiques en biologie moléculaire
  • d'assurer ou faciliter l’acquisition de savoir-faire techniques et analytiques par l’encadrement, la formation et l’accompagnement des utilisateurs
  • d'assurer une veille méthodologique et technique
Équipe

Agents

Julie VASSEUR, IE MNHN, Jardin des plantes, Paris 5

Pavithra SUNDARARAJU, IE MNHN, Jardin des plantes, Paris 5 

Coordinateurs scientifiques

Agnès DETTAÏ, MC MNHN (UMR ISYEB 7205), Jardin des plantes, Paris 5

Cyril GALLUT, MC MNHN (UMR ISYEB 7205), station de Concarneau

Accès

Modalités d'accès aux ressources du SSM

Le plateau technique est ouvert à l'ensemble des unités du muséum et aux extérieurs.

Vous trouverez plus d’informations sur le fonctionnement du SSM ci-dessous

    

L’accès aux ressources du plateau technique se fait après validation par le SSM de votre projet sur la base de sa faisabilité, ainsi qu'une formation hygiène et sécurité obligatoire pour tous les nouveaux entrants.

Soumettre un projet au SSM

Vous pouvez soumettre votre projet au SSM sur la plateforme Platech via le formulaire (interface PLATECH) .

Pour plus d’informations, ou pour une aide concernant le dépôt de projet sur Platech, veuillez contacter: ssm-contact(a)mnhn.fr

Accès et fonctionnement du SSM

Après validation du projet par l’équipe SSM, l’accès au SSM se fait via un planning de réservation disponible sur Teams (Equipe « Utilisateurs SSM »  Fichiers  Réservations SSM).

Pour toute demande en lien avec l’accès, veuillez contacter : ssm-contact(a)mnhn.fr

Publier des résultats issus du SSM

Afin de remercier le plateau pour l'accès et les moyens fournis, l’UAR 2700 et le Service de Systématique Moléculaire doivent obligatoirement figurer au moins dans les remerciements et toute parution d’article doit être signalée dès son acceptation avec envoi final d'un tiré à part au format PDF.

Ressources

Extraction :  Biorupteur (sonicateur), robot Epimotion, thermomixeurs

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Pré-PCR : conservation des échantillons et préparation des mix PCR

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Salle PCR : Thermocycleurs /centrifugeuses

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Post-PCR : visualisation de gels de migration dans une UV e-box

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Nouveaux Laboratoires SSM
Crédits
©MNHN Ludivine Longou

 

Analyse quantitative et qualitative : Bioanalyser, Qubit, Fragment Analyser

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Sélection et préparation automatisée d'ADNs de taille définie : Blue Pippin

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Amplification précise : Droplet Digital PCR (préparation de librairies NGS, détection de variant, quantification, mesure d’expression différentielle)

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Séquençage : Méthode Sanger via Eurofins, MiSeq (Illumina), Seq studio

 

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Publié le : 08/10/2021 12:07 - Mis à jour le : 09/07/2023 00:38