atelier « Introduction à l’assemblage de génomes »

Description: Malgré les progrès technologiques permettant l’assemblage de génomes « telomere-to-telomere », l’assemblage reste une étape difficile pour de nombreux génomes non standards. L’objectif de l’atelier est de:

- connaître les principes généraux des méthodes d’assemblages de génomes complets

- connaître les différents types de données de séquençage et leurs spécificités

- apprendre à concevoir et appliquer des pipelines d’assemblages, du prétraitement des données aux étapes de polishing

- connaître et appliquer des outils communs d’évaluation des assemblages produits

Pré-requis: Les participant.es doivent avoir une connaissance de base d’unix (équivalent à l’atelier « Linux et la ligne de commande »).